功能性灭绝是指某个或某类生物在自然条件下，种群数量减少到无法维持繁衍的状态。导致物种功能性灭绝的因素包括但不限于：气候或环境变化，自然或人为灾害，饮食资源缺失，外来物种入侵，自身遗传缺陷，疾病，人类捕杀，栖息地被人类侵占、割裂、干扰、破坏、污染等。
功能性灭绝是物种灭绝的前兆，当一个种群规模不足以自我维持繁衍的生物，往往只能苟延残喘，任凭种群一步步衰落、消亡。存世个体越来越少，继而找不到合适的配偶，无法生育后代，最后彻底绝灭。但在人类的及时抢救下，也有成功挽回的例子，如欧洲野牛、麋鹿、亚洲狮、朱鹮等。
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